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工作描述
职位1(研究人类进化/复杂性状遗传学的计算科学家)
候选人将参与推断非洲人群的人口历史,确定人类进化史上的适应性的遗传基础,描述影响人类组织和单细胞的基因调控的遗传和表观遗传因素,描述全基因组短读和长读测序数据的变异,和/或研究复杂性状的基因型/表型关联。理想的计算候选人将有很强的计算/统计技能,在处理大型基因组数据集、群体遗传学分析和/或复杂性状的定量分析方面有经验。
职位2(进行功能基因组学研究的科学家)
候选人将使用功能基因组学方法来确定由GWAS和选择扫描确定的候选因果变体对蛋白质功能、基因调控和染色质相互作用的影响。理想的功能基因组学候选人将拥有使用尖端技术来描述基因调控和染色质结构的专业知识(例如,单细胞测序、大规模并行报告测定、染色体构象捕获、RNA-seq、ATAC-seq、ChIP-seq)。
职位3(研究人类免疫反应的科学家)
候选人将使用单细胞测序技术(RNA-seq和ATAC-seq)来研究影响不同祖先和环境的人群的免疫反应的遗传和表观遗传因素。
实验室简介
Tishkoff实验室整合基因组、转录组、元基因组、代谢组和表观基因组数据集,这些数据集产生于美国不同种族的非洲人、非裔美国人和非洲移民的大型样本。使用进化、统计、群体遗传学和功能基因组学的方法来了解一些人体测量、心血管、代谢和免疫相关性状的遗传结构。
主要研究方向:
非洲综合进化基因组学
非洲基因组和表型多样性项目
抵抗传染病的遗传基础
人类适应性的遗传基础
部分出版物
1.Sirugo, G, Williams Scott M, and Tishkoff SA, The missing diversity in human genetic studies, Cell, Mar 21;177(1):26-31. doi: 10.1016. 2019.(IF41.582)
2.Gouveia MH, Borda V, Leal TP, Moreira RG, Bergen AW, Kehdy FSG, Alvim I, Aquino MM, Araujo GS, Araujo NM, Furlan V, Liboredo R, Machado M, Magalhaes WCS, Michelin LA, Rodrigues MR, Rodrigues-Soares F, Sant Anna HP, Santolalla ML, Scliar MO, Soares-Souza G, Zamudio R, Zolini C, Bortolini MC, Dean M, Gilman RH, Guio H, Rocha J, Pereira AC, Barreto ML, Horta BL, Lima-Costa MF, Mbulaiteye SM, Chanock SJ, Tishkoff SA, Yeager M, Tarazona-Santos E. Origins, admixture dynamics and homogenization of the African gene pool in the Americas. Mol Biol Evol. Mar 3. pii: msaa033. doi: 10.1093/molbev/msaa033. [Epub ahead of print], 2020.(IF16.24)
3.Rubel MA, Abbas A, Taylor LJ, Connell A, Tanes C, Bittinger K, Ndze VN, Fonsah JY, Ngwang E, Essiane A, Fokunang C, Njamnshi AK, Bushman FD, Tishkoff SA. Lifestyle and the presence of helminths is associated with gut microbiome composition in Cameroonians. Genome Biol. May 25;21(1):122. doi: 10.1186/s13059-020-02020-4. 2020.(IF13.583)
申请要求
1.有免疫学背景和丰富的细胞培养经验。
2.有建库或单细胞数据分析经验者优先。
3.具有良好的科学思维;
4.具有良好的英语表达和写作能力。
福利待遇
1.候选人将获得与资格和经验相称的高薪。
2.候选人将有机会发展创造性的独立项目。
3.候选人将有机会在会议上展示他们的工作。
4.为候选人提供一个高度合作和学术支持的环境。